1. 3대 호카게 "히루젠" 은 수명이 다해 죽었다.

 

2. 4대호카게 "미나토" 는  오로치마루의 나뭇잎 침공을 막다 살해당했다. 다만 오로치마루 역시 시귀봉진으로 사신에게 두 손을 봉인당한다.

 

3. 5대 호카게는 ' 우치하 오비토 ' 이다. 그의 조언자는 카카시고 아내는 린이다.

 

4. 우치하의 쿠데타는 시스이와 이타치의 노력으로 일단락 되었다. 일족을 강경하게 처단하려는 단조에게 시스이는 가장 강력한 환술을 건다.

 

5. 쿠시나 밑에서 아버지 없이 자란 나루토는 성격이 밝지만 닌자학교의 성적은 영 좋지 못하다. 하지만 우치하 사스케는 제 형 만큼이나 명석했다.

 

6. 제 7반의 담임은 사스케의 형이자 상급닌자인 ' 우치하 이타치 ' 가 되었다.

 

7. 자칭 우치하 마다라 라는 인간이 우치하의 계몽을 위해서라며 경무부대 대장인 우치하 후가쿠에게 접근해 자신의 정체를 밝히고 그를 설득시키는데 성공한다.

 

8. 우치하지만 우치하보다 다른걸 더 중요시하는 5대 호카게를 제거하기 위한 계획을 세우게 된다. 시스이가 이를 알아채고 오비토에게 알리려고 하지만 그걸 막으려는 우치하 마다라와 싸우게 된다. 가장 강력한 환술을 사용하지 못하게 된 시스이는 치열한 싸움끝에 마다라에게 살해당한다.그리고 마다라의 조직인 아카츠키가 활동을 시작한다.

 

9. 아카츠키의 목적은 미수 사냥 , 그것을 위해 쿠시나를 납치하려고 한다. 그와중에 쿠시나를 지키려다 나루토가 크게 부상을 입는다.그리고 그걸 본 사스케는 가장 친한 친구가 다쳤다는 분노로인해 사륜안을 개안한다. 결국 지라이야와 이타치의 개입으로 아카츠키는 후퇴한다. 쉽사리 뚫린 마을의 경계에 의문을 가진 지라이야는 나루토와 쿠시나를 비마을로 데려간다. 그리고 비마을의 패권을 잡은 자신의 첫 제자인 우즈마키 나가토에게 같은 일족인 쿠시나 모자를 부탁하고 나루토는 나가토를 스승으로 두게 된다. 마을로 돌아온 지라이야는 오비토에게 우치하가 수상하다고 조언하지만 자신의 일족이니 만큼 오비토는 쉽사리 갈피를 잡지 못한다.

 

9.  시스이의 가장 절친한 친구인 이타치는 그의 죽음을 조사하던 도중 일족이 그의 죽음에 개입하게 된것을 알게된다. 하지만 이미 그 사실을 알았을땐 쿠데타는 시작되었고 온건파 쪽이었던 호카게 쪽은 불시의 기습에 제대로된 저항도 해보지 못하고 몰살당했다. 이 과정에서 과거 미나토 반 인원들이 모두 죽는다. 이에 일족에 환멸을 느낀 이타치는 동생인 사스케를 데리고 마을에서 떠난다. 휴우가도 이를 계기로 마을에서 떠나 정처없이 떠돌게 된다. 마을은 완벽하게 우치하의 손안에 들어온다.

 

10. 9미를 잡기위해 마다라가 직접 나서게 되고 아카츠키가 비마을로 쳐들어오게 된다. 전설적인 눈인 윤회안을 가진 나가토와 아직 맞붙을 준비가 되지 않은 마다라는 강자들을 나가토에게 보내고 자신은 따로 쿠시나를 찾아내 나루토의 눈앞에서 그녀를 죽이고 구미의 봉인을 풀었다. 하지만 강인한 생명력을 가진 쿠시나는 바로 죽지 않고 풀려난 구미를 억제 시킨다. 뒤늦게 도착한 지라이야와 그가 데려온 츠나데가 마다라를 막아서고 힘의 반밖에 회복하지 못했던 마다라는 일단 후퇴하기로 한다.

더이상 허약해진 신체에 구미를 봉인 할수없게 된 쿠시나는 마지막으로 나루토에게 하고싶은 말을하며 나루토에게 미안하다며 어쩔수없이 아들에게 구미를 봉인한다. 이로 인해 나루토의 감정선에 큰 변화가 생겨버린다.

 

11. 우치하에게 빼앗긴 마을을 되찾기위해 전설의 3 닌자중 지라이야와 츠나데 나루토 그리고 우치하 형제, 휴우가가 뭉치게되고 이를 나가토의 비마을이 지원한다.

그리고 서쪽변방에 " 소리마을 " 이라는 새로운 마을이 생겨났다.

 

 

일단 1부 

 

2부의 주요인물 - 나루토 사스케 이타치 마다라 지라이야 츠나데 오로치마루 후가쿠 아카츠키 일당 나가토 멤버 등등..