제1화「초전자포(레일건)」
인구 180만 명을 넘는 학생들이 모여, 초능력 개발이 진행되고 있는 거대도시「학원도시」.
초전자포·미사카 미코토는 그 뒷골목에서 가녀린 소녀를 덮치려는 불량학생들과 조우하자,
평소처럼 전격으로 그들을 일축한다.
이튿날, 전에 일어난「폴터가이스트 사건」의 피해자인 에다사키를 문병하기로 한 미코토 일행은,
그녀와의 오랜만의 재회를 기대하며 병원을 방문한다.
제2화「수명중단(크리티컬)」
미코토 일행은 사회견학을 앞두고 필요한 물건을 사러 나가, 그 도중에 현금카드가 든 봉투를 줍는다.
그때에는 신경 쓰지 않았던 미코토지만 이튿날, 코노리에게 여기저기서 똑같은 유실물이 잇따른다는
이야기를 듣는다. 소문을 들은 사텐에게 이끌려 미코토는 현금카드 찾기에 종일 따라다니게 돼 녹초가 된다.
그리고 그녀의 귀에 봉투를 떨어뜨린 것 같다는 소녀를 발견했다는「스킬 아웃」의 이야기가 들려오고…
제3화「초전자포 양산(레디오 노이즈) 계획」
학원도시에 그럴싸하게 소문이 퍼진 레벨5의 클론을 제조 중이라는 계획.
자신이 그 모델이 된 것 같다는 걸 안 미코토는 이루 말할 수 없는 불안감을 안고서 조사를 시작한다.
제4화「여동생들(시스터즈)」
충격적인 사실을 안 미코토는 불안감을 얼버무리기 위해 씩씩하게 행동한다.
쿠로코는 그런 미코토의 모습에 위화감을 느낀다.
그러던 중, 우이하루 일행과 합류한 미코토는 쇼핑몰로 쇼핑을 가게 된다.